Page 128 - Perdih, Andrej, Katja Lakota, Alja Prah. 2020. Strukture bioloških molekul. Univerzitetni učbenik z recenzijo in navodila za vaje. Koper: Založba Univerze na Primorskem.

andrej perdih, katja lakota, alja prah

Počakamo nekaj trenutkov in dobimo rezultate iskanja.

V našem primeru smo dobili 105 zadetkov, barvna lestvica predstavlja delež podobnosti
iskanega aminokislinskega zaporedja z zadetki. Rdeča barva predstavlja najboljše ujemanje
zaporedji. Več informacij o posameznih ujemanjih zaporedij dobimo v razdelku Description,
kjer so podane E vrednosti, pri čemer nižja E vrednost pomeni boljše ujemanje zaporedji. BLAST
poročilo rezultatov vsebuje še povezave do zunanjih virov, poravnave zadetkov s preiskovanim
zaporedjem, taksonomsko poročilo in ostalo.

4. DRUGE UPORABNE BAZE S PODATKI O POSAMEZNIH GENIH/PROTEINIH

KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) je podatkovna baza za razumevanje
delovanja bioloških sistemov, kot so celice, organizmi in ekosistemi. Omogoča razumevanje
podatkov, pridobljenih s sekvenciranjem genomov in ostalimi visokozmogljivostnimi
tehnologijami. Vsebuje 16 podatkovnih baz (biološke poti, genom, funkcionalni ortologi itd.).
Pogledali si bomo podbazo KEGG PATHWAYS, ki je zbirka ročno zgrajenih map bioloških poti. V
njej so opisane molekularne interakcije in reakcijske poti metabolizma, procesiranja genetskih
informacij, procesiranja okoljskih informacij, celičnih procesov organskih sistemov in človeških
bolezni. V iskalnik KEGG PATHWAYS (http://www.genome.jp/kegg/pathway.html) vpišemo
TLR3 in kliknemo GO.

128