Page 130 - Perdih, Andrej, Katja Lakota, Alja Prah. 2020. Strukture bioloških molekul. Univerzitetni učbenik z recenzijo in navodila za vaje. Koper: Založba Univerze na Primorskem.

andrej perdih, katja lakota, alja prah

GeneCards (https://www.genecards.org/) je podatkovna baza o humanih genih/proteinih, ki
združuje podatke več podatkovnih baz o genomu, proteomu, transkriptomu in povezavah s
kliniko, obenem pa ima povezave/podatke o posameznih proizvajalcev za detekcijo/izvedbo
bioloških eksperimentov. Vpišite v GeneCards encim GAPDH in poiščite odgovore na naslednja
vprašanja.

• Na katerem kromosomu se nahaja gen?
• Kakšna je velikost proteina in kvartarna struktura?
• S katerimi proteini interagira?
• Katera zdravila vplivajo na izražanje GAPDH?
• Kateri SNPi so znani pri Homo sapiens?
• Poiščite povezavo na evolucijsko drevo (Evolution tree na ENSEMBL).
• Poiščite ortologe/paraloge/homologe vašega gena.

Podobna stran Evropskega bioinformatičnega inštituta in Švicarskega inštituta za
bioinformatiko je tudi UniProt (https://www.uniprot.org/). Poskušajte za encim GAPDH na tej
strani najti naslednje podatke.

• Kateri družini proteinov pripada, kakšne domene in motive vsebuje?
• Kakšne mutacije so znane?
• Katere aminokisline so modificirane?

130