Page 126 - Perdih, Andrej, Katja Lakota, Alja Prah. 2020. Strukture bioloških molekul. Univerzitetni učbenik z recenzijo in navodila za vaje. Koper: Založba Univerze na Primorskem.
P. 126
andrej perdih, katja lakota, alja prah
3. SPLETNA ORODJA ZA DELO Z ZAPOREDJI
NCBI je podatkovna baza ameriške medicinske knjižnjice (US NLM) in je pomemben vir
bioinformatičnih podatkov in orodij. Delo z zaporedji si bomo ogledali na primeru njenega
spletno dostopnega vmesnika BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). BLAST je algoritem
za primerjanje primarnih bioloških zaporedji, kot so aminokislinska zaporedja proteinov in
nukleotidna zaporedja nukleinskih kislin. BLAST služi tudi kot iskalno orodje za primerjavo
preiskovanih zaporedij in identifikacijo podobnih zaporedij v knjižnicah ali podatkovnih bazah
zaporedij.
V spletni podatkovni bazi NCBI Protein (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein) v iskalnik
najprej vpišemo TLR3 in kliknemo na »FASTA« v prvem zadeteku:
126
3. SPLETNA ORODJA ZA DELO Z ZAPOREDJI
NCBI je podatkovna baza ameriške medicinske knjižnjice (US NLM) in je pomemben vir
bioinformatičnih podatkov in orodij. Delo z zaporedji si bomo ogledali na primeru njenega
spletno dostopnega vmesnika BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). BLAST je algoritem
za primerjanje primarnih bioloških zaporedji, kot so aminokislinska zaporedja proteinov in
nukleotidna zaporedja nukleinskih kislin. BLAST služi tudi kot iskalno orodje za primerjavo
preiskovanih zaporedij in identifikacijo podobnih zaporedij v knjižnicah ali podatkovnih bazah
zaporedij.
V spletni podatkovni bazi NCBI Protein (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein) v iskalnik
najprej vpišemo TLR3 in kliknemo na »FASTA« v prvem zadeteku:
126
