Page 135 - Perdih, Andrej, Katja Lakota, Alja Prah. 2020. Strukture bioloških molekul. Univerzitetni učbenik z recenzijo in navodila za vaje. Koper: Založba Univerze na Primorskem.
P. 135
strukture bioloških molekul
Nato izberemo Map in kliknemo na download ob EDS map.
Preneseno datoteko 2jff.ccp4 preimenujemo v 2JFF.map.ccp4.
2. PRIKAZ MAPE ELEKTRONSKE GOSTOTE
Odpremo program PyMOL in v meniju z ukazom »File/Open« naložimo preneseno datoteko
2JFF.map.ccp4. Najprej se v grafičnem oknu nič ne spremeni. V nadaljevanju v oknu imen
struktur na desni strani kliknemo na gumb »2JFF.map«, pojavi se oris prazne kocke. Nato v
vrstici gumba 2JFF.map izberemo »A« (»Action«) in »mesh« ter »@ level 3.0«:
S tem ukazom ustvarimo nov zaznamek »2JFF.map_mesh« in v grafičnem oknu se v kocki pojavi
elektronska mapa gostote nivoja 3.0.
135
Nato izberemo Map in kliknemo na download ob EDS map.
Preneseno datoteko 2jff.ccp4 preimenujemo v 2JFF.map.ccp4.
2. PRIKAZ MAPE ELEKTRONSKE GOSTOTE
Odpremo program PyMOL in v meniju z ukazom »File/Open« naložimo preneseno datoteko
2JFF.map.ccp4. Najprej se v grafičnem oknu nič ne spremeni. V nadaljevanju v oknu imen
struktur na desni strani kliknemo na gumb »2JFF.map«, pojavi se oris prazne kocke. Nato v
vrstici gumba 2JFF.map izberemo »A« (»Action«) in »mesh« ter »@ level 3.0«:
S tem ukazom ustvarimo nov zaznamek »2JFF.map_mesh« in v grafičnem oknu se v kocki pojavi
elektronska mapa gostote nivoja 3.0.
135
