Page 141 - Perdih, Andrej, Katja Lakota, Alja Prah. 2020. Strukture bioloških molekul. Univerzitetni učbenik z recenzijo in navodila za vaje. Koper: Založba Univerze na Primorskem.
P. 141
strukture bioloških molekul
2. PREMIKANJE IN PRIBLIŽEVANJE STRUKTURE
Protein lahko vrtimo s klikom na levo miškino tipko in povlekom kazalca nad strukturo. Na
podoben način z uporabo srednjega miškinega gumba dosežemo translacijsko premikanje. S
potegom desne miškine tipke lahko približujemo/oddaljujemo strukturo.
3. PRIKAZOVANJE ELEMENTOV SEKUNDARNE STRUKTURE
Struktura proteina β-laktamaze je prikazana v obliki trakov. Trakove lahko obarvamo glede
na elemente sekundarne strukture, kot so vijačnice, ploskve, zanke. Odpremo modelno
ploščo z izbiro menija »Tools/Depiction/Color Secondary Structure«. Odprlo se je okno
»Color Secondary Structure« v katerem so s kljukico označeni »Helix«, »Strand« and »Coil«.
Za vsako izmed njih lahko poljubno spreminjamo barvni prikaz v »Color Editor« oknu. Ko
izberemo želene barve, kliknemo »Apply«. Obarvane sekundarne strukture bi morali videti
nekako takole, kot je prikazano na spodnji sliki.
141
2. PREMIKANJE IN PRIBLIŽEVANJE STRUKTURE
Protein lahko vrtimo s klikom na levo miškino tipko in povlekom kazalca nad strukturo. Na
podoben način z uporabo srednjega miškinega gumba dosežemo translacijsko premikanje. S
potegom desne miškine tipke lahko približujemo/oddaljujemo strukturo.
3. PRIKAZOVANJE ELEMENTOV SEKUNDARNE STRUKTURE
Struktura proteina β-laktamaze je prikazana v obliki trakov. Trakove lahko obarvamo glede
na elemente sekundarne strukture, kot so vijačnice, ploskve, zanke. Odpremo modelno
ploščo z izbiro menija »Tools/Depiction/Color Secondary Structure«. Odprlo se je okno
»Color Secondary Structure« v katerem so s kljukico označeni »Helix«, »Strand« and »Coil«.
Za vsako izmed njih lahko poljubno spreminjamo barvni prikaz v »Color Editor« oknu. Ko
izberemo želene barve, kliknemo »Apply«. Obarvane sekundarne strukture bi morali videti
nekako takole, kot je prikazano na spodnji sliki.
141
