Page 168 - Perdih, Andrej, Katja Lakota, Alja Prah. 2020. Strukture bioloških molekul. Univerzitetni učbenik z recenzijo in navodila za vaje. Koper: Založba Univerze na Primorskem.
P. 168
andrej perdih, katja lakota, alja prah
I. BIOLOŠKE MAKROMOLEKULE
• Iz katerih pomembnejših molekul je sestavljeno človeško telo?
• Opišite ogljikove hidrate.
• Naštejte nekatere pomembnejše polisaharide.
• Kakšna je razlika med nasičenimi in nenasičenimi maščobnimi kislinami?
• Kaj so fosfolipidi in zakaj so pomembni?
• Kaj so nukleinske kisline in kaj nukleotidi?
• Kaj so bazni pari in kaj pomeni, da so komplementarni?
• Naštejte in opišite vlogo nekaj tipov RNA.
• Kaj je osrednja dogma molekularne biologije?
• Opišite replikacijo DNA.
• Opišite transkripcijo in translacijo DNA.
• Kaj pomeni, da je gentska koda degenerirana?
• Opišite proteine. Kaj je domena?
• Kaj so aminokisline? Narišite osnovno formulo in naštejte nekaj primerov.
• Opišite primarno/sekundarno/terciarno/kvartarno strukturo proteinov.
• Naštejte nekaj pomembnejših funkcij proteinov v telesu.
• Kaj so agonisti in kaj antagonisti?
• Kaj so encimi in kako delujejo? Kako delimo inhibitorje encimov?
• Kaj so protitelesa?
II. DOLOČEVANJE 3D STRUKTURE BIOLOŠKIH MOLEKUL S KRISTALOGRAFIJO
• Opišite metodo proteinske kristalografije.
• Zakaj pri tej metodi uporabljamo rentgenske žarke?
• Opišite metodo viseče kapljice.
• Narišite shematsko difrakcijski eksperiment in aparaturo.
• Kaj je to Fouriejeva transformacija in zakaj jo uporabljamo v proteinski kristalografiji?
• Kako v kristalografiji rešujemo fazni problem?
• Kako iz elektronske gostote dobimo molekulski model proteina?
• Opišite nekatere kriterije, s katerimi opredelimo kvaliteto strukture, določene z metodo
proteinske kristalografije.
III. DOLOČEVANJE 3D STRUKTURE BIOLOŠKIH MOLEKUL Z NMR SPEKTROSKOPIJO
• Opišite 1D NMR eksperiment.
• Katera jedra lahko uporabljamo pri NMR eksperimentih?
• Kako Fouriejevo transformacijo uporabljamo v NMR spektroskopiji?
• Kaj je kemijski premik in zakaj do njega pride?
• Opišite razlog za 1H-1H sklopitev jeder (primer dubleta in tripleta).
• Zakaj pri določevanju struktur proteinov potrebujemo večdimenzionalne NMR spektre?
• Katere podatke dobimo iz 2D NOESY in 2D COSY NMR spektrov?
• Kaj je jedrni Overhauserjev efekt NOE in zakaj je pomemben v NMR spektroskopiji?
168
I. BIOLOŠKE MAKROMOLEKULE
• Iz katerih pomembnejših molekul je sestavljeno človeško telo?
• Opišite ogljikove hidrate.
• Naštejte nekatere pomembnejše polisaharide.
• Kakšna je razlika med nasičenimi in nenasičenimi maščobnimi kislinami?
• Kaj so fosfolipidi in zakaj so pomembni?
• Kaj so nukleinske kisline in kaj nukleotidi?
• Kaj so bazni pari in kaj pomeni, da so komplementarni?
• Naštejte in opišite vlogo nekaj tipov RNA.
• Kaj je osrednja dogma molekularne biologije?
• Opišite replikacijo DNA.
• Opišite transkripcijo in translacijo DNA.
• Kaj pomeni, da je gentska koda degenerirana?
• Opišite proteine. Kaj je domena?
• Kaj so aminokisline? Narišite osnovno formulo in naštejte nekaj primerov.
• Opišite primarno/sekundarno/terciarno/kvartarno strukturo proteinov.
• Naštejte nekaj pomembnejših funkcij proteinov v telesu.
• Kaj so agonisti in kaj antagonisti?
• Kaj so encimi in kako delujejo? Kako delimo inhibitorje encimov?
• Kaj so protitelesa?
II. DOLOČEVANJE 3D STRUKTURE BIOLOŠKIH MOLEKUL S KRISTALOGRAFIJO
• Opišite metodo proteinske kristalografije.
• Zakaj pri tej metodi uporabljamo rentgenske žarke?
• Opišite metodo viseče kapljice.
• Narišite shematsko difrakcijski eksperiment in aparaturo.
• Kaj je to Fouriejeva transformacija in zakaj jo uporabljamo v proteinski kristalografiji?
• Kako v kristalografiji rešujemo fazni problem?
• Kako iz elektronske gostote dobimo molekulski model proteina?
• Opišite nekatere kriterije, s katerimi opredelimo kvaliteto strukture, določene z metodo
proteinske kristalografije.
III. DOLOČEVANJE 3D STRUKTURE BIOLOŠKIH MOLEKUL Z NMR SPEKTROSKOPIJO
• Opišite 1D NMR eksperiment.
• Katera jedra lahko uporabljamo pri NMR eksperimentih?
• Kako Fouriejevo transformacijo uporabljamo v NMR spektroskopiji?
• Kaj je kemijski premik in zakaj do njega pride?
• Opišite razlog za 1H-1H sklopitev jeder (primer dubleta in tripleta).
• Zakaj pri določevanju struktur proteinov potrebujemo večdimenzionalne NMR spektre?
• Katere podatke dobimo iz 2D NOESY in 2D COSY NMR spektrov?
• Kaj je jedrni Overhauserjev efekt NOE in zakaj je pomemben v NMR spektroskopiji?
168
